这样的举动自然引起日方的高度不满。日本政府当天就向俄罗斯提出抗议，首相菅直人当晚也在官邸就此事表达了“遗憾”。外相前原诚司在记者会上批评说，俄防长此时视察北方领土是在给日俄关系“泼冷水”，与其声称希望改善两国关系的愿望不相符。

不过，总体而言，日本不仅没有实质意义的反制举措，就是言语上的反应也非常克制，多为遗憾之类的措辞。英国《经济学家》杂志评论说，日本的抗议方式总是“生机勃勃”，但内容却“无关痛痒”。日本在野党也批评政府“外交失策”。在此情况下，日本政府提高了批评声调。2月7日这天，菅直人抨击俄罗斯总统梅德韦杰夫去年11月的登岛行为是“难以容忍的粗暴行径”。一国领导人以这样的措辞指名道姓批评另一国领导人，这在和平时期的外交实践中并不多见。　　

面对日本的指责，俄罗斯不仅没有任何示弱的意思，反而也提高了反击力度。俄外交部2月7日发表声明说，日本今年“北方领土日”举行的活动，表现出“特别严重的反俄情绪”，从外交礼仪上看，那些针对俄总统和其他高级官员的言论是“完全不能接受的”。俄罗斯总统助理普里霍季科的话则更具刺激性，他对媒体表示，“如果日本人认为俄总统视察本国领土是在羞辱日本，那么这种羞辱将继续下去。”